Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf170A2RU37 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms