Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A0A0U1RQF3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms