Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSAG2Q9Y5P2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSAG2Q9Y5P2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms