Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GIT1Q9Y2X7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GIT1Q9Y2X7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms