Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOD1Q9Y239 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms