Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC2Q9Y235 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms