Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms