Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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