Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DSEQ9UL01 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms