Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NDUFA12Q9UI09 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms