Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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