Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRBP1Q9P2E9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRBP1Q9P2E9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms