Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK13-1Q9NX77 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK13-1Q9NX77 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms