Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC39A9Q9NUM3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms