Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP26Q9NRE1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms