Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms