Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms