Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH6AQ9H0K4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms