Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms