Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms