Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms