Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms