Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms