Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM43Q9BTV4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms