Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms