Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms