Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCLRE1CQ96SD1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCLRE1CQ96SD1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms