Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms