Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf72Q96LT7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 353.8 ms