Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms