Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms