Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms