Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNDC1Q96C34 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms