Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms