Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms