Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD12Q8N8I0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms