Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms