Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms