Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTROBQ8N137 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTROBQ8N137 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTROBQ8N137 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTROBQ8N137 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTROBQ8N137 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTROBQ8N137 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTROBQ8N137 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTROBQ8N137 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTROBQ8N137 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTROBQ8N137 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTROBQ8N137 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTROBQ8N137 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms