Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms