Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms