Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms