Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms