Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms