Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms