Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF880Q6PDB4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms