Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF6Q6KF10 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms