Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BROXQ5VW32 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms