Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNT1Q5JUK3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNT1Q5JUK3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms