Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms